Posted By: komanek (komanek) on 'CZscience'
Title: mtDNA
Date: Wed May 17 14:57:36 1995
Ahoj Bhakto i ostatni !
> Me by teda zajimaly dve veci:
> 1) Co to vlastne ta mytochondrialni DNA je a jak se lisi od ty 'normalni'.
> 2) Jakou chybou jsou zatizeny vypocty zalozene na techto 'hodinach'.
>
Mitochondrialni DNA (dale jen mtDNA) je geneticka vybava mitichondrii.
Mitochondrie jsou bunecne organely, jejichz nejnapadnejsi a v ucebnicich take
obvykle citovanou funkci je zajistovat bunecne dychani. Existuje tzv.
endosymbioticka teorie (pro stouraly 'teorie serialni endosymbiozy'), podle
niz jsou mitochondrie puvodne organismy podobne bakteriim (Prokaryota), ktere
vstoupily v symbioticky vztah s jinou bunkou. Jednim ze silnych argumentu
je zde prave zpusob organizace genetickeho materialu. Zde jsou hlavni
odlisnosti mtDNA od jaderne DNA - tedy alespon ty, na ktere si ted umim
vzpomenout :
- mtDNA je cyklicka, tzn. bez zacatku a konce
- obsahuje jen nekolik desitek funkcnich genu a ve srovnani s jadernou DNA je
dosti kratka
- vyuziva transkripcniho a translacniho aparatu bakterialniho typu, i kdyz i
s urcitymi odchylkami (napr v genetickem kodu)
- nestaci k vystavbe cele mitochondrie, musi tu asistovat jaderny genom
- jeji primarnistruktura (vlastni polynukleotidovy zapis pomoci C,G,T,A atd.)
je pomerne dobre zmapovana a zda se byt velice konzervativni (= male rozdily i
mezi na prvni pohled znacne odlisnymi taxony).
Nektere ze zminenych vlastnosti mtDNA lze s vyhodou vyuzit pro pokus o
datovani, resp. spise pro pokus o synchronizaci pohledu na jednotlive
vyvojove linie. Zejmena jeji konzervativnost => mala rychlost mutaci =>
relativne snadne hodnoceni zmen v genet. zapisu. Srovnanim toho, kde a jak
moc se od sebe genet. inf. mtDNA ruznych taxonu lisi s geografickymi udaji
lze odhadovat pravdepodobne smery migraci a miru diferenciace taxonu . Po
porovnani s paleontologickymi daty se dale usuzuje na skutecne stari linie.
Tak to bylo velice strucne k prvni otazce. A ted ke druhe :
Chybu nejsem schopen procentualne vycislit - je zavisla na okolnostech, o
kterych nevime, protoze je z historie lokality neumime precist. Je to proste
metoda, ktera by mohla byt spravna za urcitych predpokladu, o kterych se hned
zminim. Je nutno si ale uvedomit, ze samozrejme existuje cela rada
matematickych postupu, ktere pravdepodobnost selhani metody snizuji, ale ty
jsou zase vystaveny na nejakych predpokladech. Takze zaver o tom, jak moc je
metoda presna ponecham na kazdem z Vas, zde jen nabidnu nektera mozna rizika,
ktere tuto metodu ohrozuji :
- mtDNA je relativne kratka, takze je zde vetsi pravdepodobnost vicenasobne
mutace na jednom nukleotidu. Kolik zmen na nukleotidu probehlo nelze zjistit
a vyznam poctu takovych zmen zavisi na kontextu, v nemz se mutace projevi.
- neni moc duvodu predpokladat, ze by pravdepodobnost mutace byla na vsech
mistech mitochondrialniho genomu stejna. Rychlost evoluce pak neni ve spravne
proporci k mereni.
- a uz vubec nelze zarucit, ze by molekularni hodiny tohoto typu sly stejne
rychle v ruznych geograf. oblastech za ruznych podminek
Tak toto je muj nazor na vec, vic mne ted nenapada.
David
> > bhakta > e-mail: janecekr@risc.upol.cz > Look at my
homepage: http://phoenix.upol.cz/~janecekr